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El proyecto se llevó a cabo en numerosos centros de investigación siendo el más importante de ellos el distrito de ingeniería de
Manhattan situado en el conocido actualmente como Laboratorio Nacional los Álamos.
El proyecto agrupó a una gran cantidad de eminencias científicas (físicos, químicos, informáticos, ingenieros;etc.) Dado que tras los experimentos en Alemania previos a la guerra se sabía que la fisión del átomo era posible y de que los nazis estaban trabajando en su propio programa nuclear, no costó mucho trabajo reunir a todas aquellas mentes brillantes que eran también pacifistas e izquierdistas en su mayoría. Exiliados judíos muchos de ellos hicieron causa común de la lucha contra el fascismo portando su grano de arena a la causa: conseguir la bomba antes que los alemanes. El primer ensayo atómico con éxito ocurrió en el desierto de Nuevo México. El artefacto se llamo Trinity y se trataba de una bomba de plutonio del mismo tipo de Fat Man, que sería lanzado sobre Nagasaki días después.
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Durante el proyecto Manhattan hubo cuatro diseños, denominados Fat Man, Little Boy, The Gadget y Thin Man
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